在傳統的活性污泥處理工藝中，有機負荷率是重要的運行控制參數，一般以有機容積負荷表征，他反映了單位容積的反應器的有機物轉化能力。研究發現絮狀物你的絮體大小會隨著有機負荷的增加而增大，而絮體的密度，空隙率，沉降速率和比表面積有與絮體的大小直接相關，故有機負荷對傳統活性污泥系統的運行效果有很大的影響。污泥顆粒化是微生物不斷繁殖，積累的過程，較高的有機負荷保證了微生物可獲得充足的營養，故有機負荷對顆粒污泥的形成也具有一定的影響作用。目前關于有機負荷對顆粒污泥的形成及特性的影響的科研結論還存在一些爭議，單有機負荷對厭氧顆粒污泥的影響作用基本上得到了認同，即有機負荷是厭氧顆粒污泥形成的關鍵因素，目前大多數學者都認為如果有機負荷較低的話，即有機負荷是厭氧顆粒污泥形成的關鍵因素，目前大多數學者都認為如果有機負荷較低的話，上流式厭氧反應器中將不會有顆粒污泥形成，而相對較高的有機負荷才可以促進UASB反應器中厭氧顆粒污泥的形成。但是有機負荷過高會使顆粒的粒徑增長較快，這回降低顆粒污泥的強度，甚至可能使新形成的顆粒污泥解體，最終導致反應器運行部穩定。有機負荷對好氧顆粒污泥形成的影響作用似乎并不如厭氧顆粒那么大，好氧顆粒污泥可以在一個非常廣泛的有機負荷范圍內實現顆粒化。但是形成顆粒污泥的特性及系統的穩定性卻與有機負荷密切相關，在有機負荷不同，其他運行條件完全相同的反應器中形成顆粒污泥的特性有明顯的差別。
      有機負荷是一個重要的運行控制參數，低有機負荷就意味著微生物的生長速率相對較慢，而當處于高有機負荷條件下時，微生物就快速生長繁殖。在厭氧反應器啟動期，就是通過逐漸增加有機負荷來加速顆粒污泥的形成。一般是在系統中的COD去除率穩定在80％以上時，再繼續增加有機負荷，同時需注意出水中MLVSS含量不能太高，以免造成污泥大量流失。一些人認為以反應器中污泥的比產甲烷活性作為提高反應器的污泥負荷的依據可以加速厭氧反應器的啟動。實驗研究表明根據污泥比產甲烷活性平均值的60％~80％來逐步提高反應器污泥這種方法以證明對加速反應器的啟動和污泥顆粒化過程是合適的。
      在厭氧顆粒污泥的培養中有研究發現，隨著有機負荷的增加，顆粒的機械強度降低，顆粒出現解體。采用M monod方程來計算UASB反應器中的微生物增長情況，發現微生物的增長速度與有機負荷成正比，而微生物的增長速率較高時會導致其所構成的三維結構的機械強度降低。另外，系統中的產氣量也與有機負荷成正比，當啟動期的有機負荷過高時，系統中會產生大量的氣體,這些氣體將會引起水力剪切力過大，這回影響到顆粒的穩定性，導致接種污泥大量流失，反應器啟動失敗。
      單較低的有機負荷有會造成系統中底物不足，特別是大顆粒污泥的中心，這可能導致顆粒穿孔或微生物自我分解，穿孔的顆粒污泥在反應器中更容易受到剪切力的作用，并有于氣泡的鞋帶作用而上浮。我們發現顆粒污泥的直徑隨負荷增大而增大。高負荷可使底物更多進入顆粒內部，從而允許大的顆粒存在和生長。減少反應器負荷會導致顆粒污泥強度降低，符合的波動會導致顆粒污泥的破碎。
      在厭氧顆粒污泥的研究中，也有研究報道稱當OLR超過了其最佳量時，系統中的VFAs會大量積累，引起反應器中PH降低，使系統運行失敗。同時發現當有機負荷較低時由于傳質阻力的限制使得顆粒內部缺乏營養物質而導致厭氧顆粒污泥解體。Kosaric等也指出在顆粒中心由于基質缺乏會導致顆粒內部出現空洞，進而引起顆粒變得疏松，強度降低。
      Kalyuzhnyi等發現隨著反應器中有機負荷的增加，顆粒內部的甲烷絲狀菌逐漸轉變為甲烷八疊球菌。Tay等研究了UASB反應器啟動過程中，底物濃度對為微生物選擇和顆粒化的影響，反應器以厭氧消化污泥為接種污泥，以含葡萄糖，蛋白陳及肉汁提取液組成的合成廢水為近水，有機負荷為1~5kgCOD/（m³.d），經過培養得到類似甲烷毛發菌屬為主的大顆粒污泥（清軍粒徑2.5~3.4mm）；然而，當有機負荷為10kgCOD/（m³.d）時，得到了以類似甲烷法疊球菌屬為主的小顆粒污泥（清軍粒徑為0.54mm）；當負荷率為10~20看kgCOD/(m³ .d)時由于懸浮顆粒進入陳江區，導致反應器運行不穩定。Ghangrekar等基于不同種類的廢水中厭氧顆粒污泥的培養的研究情況曾建議厭氧顆粒污泥培養的最佳有機負荷為2.0~4.5kgCOD/(m³.d)，單Manoj等人認為最佳的有機負荷應在考慮其他各種因素后才能確定。